月经结束后第三天同房是否会怀孕，要看月经期是几天，如果在七天内，月经干净后第三天是安全期同房基本是不会怀孕的，但也不能完全排除，也有排卵提前的可能。如果实在担心怀孕，还没有超过72小时，可以吃紧急避孕药进行补救避孕。
月经干净后3天属于安全期，性生活时没有采取避孕措施也不会怀孕，但安全期不是绝对的安全，因为很多原因(如精神因素，疾病，药物，环境等）都可以影响女性的排卵.如果近期没有生育的打算，性生活时采取有效的避孕措施，以免导致意外怀孕。
怀孕以后是没有月经的，但是也有极少一部分人，在怀孕的时候也可能会来月经，是非常不正常的，需要去医院检查一下，如果说时候来月经了，不排除有先兆流产的可能，必须引起足够的重视。而且怀孕以后是不会来月经的。
如果月经推迟一周以上，目前少量阴道出血可能是月经来潮的表现，另一种可能是怀孕和先兆流产。如果女性不放心，做一个彩色多普勒超声检查。如果可以排除怀孕，那就是月经来潮的表现。目前恶心和呕吐的症状应该是消化不良的表现。女性可以服用一些药物来帮助消化。
通常情况下，月经来了不会怀孕。具体分析如下：
如果患者的月经来了，就算此时同房，一般是不会怀孕的，如果患者怀疑自己怀孕，建议及时到医院去检查，首先要查血绒毛膜促性激素，明确是否怀孕，做妇科检查了解阴道、宫颈的情况以及出血的来源，彩超检查了解宫腔内有无占位性病变或者有无妊娠的依据、有无盆腔积液，双侧附件区有占位性病变。如果血绒毛膜促性激素检查结果是正常的，可以排除怀孕。
一般来说，月经很少，有部分可以正常怀孕，有部分就比较难怀孕。因为怀孕的前提是卵子发育良好、生殖道通畅、子宫内膜厚、男性为精液，如果符合以上的情况，就能顺利受孕。有些女人来例假比较多，有些人内分泌紊乱，体内雌激素降低，从而出现月经量少，荷尔蒙含量不正常。还有一些妇女由于子宫内膜较薄，导致受精蛋着床不方便，所以很容易出现妊娠。有的女人是由于体重过重，所以来的次数比较多，如果服用了过量的瘦身药物，会对人体造成一定的损伤，从而造成激素紊乱，从而造成闭经、不育。
建议患者保持良好的心态，同时注意休息，保证饮食营养的均衡摄入。
