女性肚脐下方疼痛常见的原因是消化道疾病，包括肠炎、便秘、肠痉挛、甚至不全性肠梗阻等等疾病。肠炎有肚脐下方疼痛，还伴有腹泻、发烧，化验血常规有白细胞升高的情况。肠功能紊乱主要是妇女食用了生冷、难以消化的食品以后，会出现小腹疼痛。
在怀孕早期出现肚子隐隐作痛，这种现象属于是正常的表现，因为在受精卵着床的过程当中会出现轻微的胀痛感觉。有一些孕妇还会伴随有轻微出血丝的现象，这种症状属于是受到体内激素分泌影响导致的。
常见的有慢性前列腺炎，多为青年男性近期性生活较频繁时容易出现，有时有憋尿的习惯，检查前列腺液可见大量的白细胞。膀胱结石，会伴有血尿、排尿困难等症状，通过膀胱B超可以诊断。
患上肝炎会有疼痛症状。肝脏是人体的代谢中心，随着肝炎不断对肝脏造成损害，从而使得人体的代谢与其它功能不能正常运行，肝功能异常就会出现肝区隐痛等不良症状。
怀孕初期小腹隐隐作痛不正常，多是由于孕妇素体血虚或脾虚化源不足，妊娠后血聚胞宫以养胎，阴血益虚，胞脉失养而致小腹隐隐作痛。可以选用中医调理，以养血安胎止痛为治疗原则，四诊合参，辨证施治，给予当归芍药散口服。
卵巢的位置隐隐作痛不能排除有慢性盆腔炎症或者是附件炎的可能性，这主要是由于月经期以及性生活之后不注意阴道卫生导致的炎症症状，或者是由于身体免疫力差感染疾病导致的。
