尿常规的检查时间，大多数选取清晨的第一泡尿，就是晨尿。选取是中段尿，排尿至一半时，再接取标本。排尿量要足一般在300ml以上，感到尿意明显时再接尿。留尿标本要在10ml以上。不建议患者从家中带来标本检查，主要是容器不能保证清洁，而且尿液存放时间长会产生一些化学反应，影响检查结果。女性在月经期间最好不要进行尿常规的检查。
尿细菌指数高要考虑存在尿路感染，如果存在尿频尿急尿痛等相关症状，或者尿白细胞酶也高，那就明确了。如果其他都没有，也不排除小便是被污染了，留的标本不合格，尿路感染。
肾结石的尿常规检查，可明确患者pH值、红细胞等情况。
尿常规检查以pH值，尿液晶体，红细胞和白细胞为主，对肾结石表现可起到一定的提示意义。pH值和结石的产生有一定的关系，尿结晶表明尿中可能存在结石成分。尿常规结果若有红细胞增高，表明结石是在一个集合系统中移动的，黏膜可有损伤。同时，患者也需接受微生物培养+药敏实验，利用结果，可对后续处理进行指导，选用敏感抗生素治疗疗效较好。
在临床中，经常发现有一些肾结石患者由于没有及时到医院就诊而延误了最佳的诊断时间，造成肾功能受到一定的损伤，甚至导致病情加重或者恶化，推荐及早进行治疗。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
尿常规检查不需要空腹进行，但是尿常规检查时，要取中段尿进行检查。检查的目的是查尿道有无异常，通常需要取初段尿进行检查。尿液的标本采集后需要马上送检，避免长时间暴露在空气中，造成尿液酸碱度以成分的改变，从而影响尿常规检查的准确性。
尿常规能够反映肾脏代谢废物水平，以及隐匿性疾病早期的临床表现，检查该项实验室检查之前，尽可能不要饮水。饮水量比较多的时候，容易冲淡尿液当中的废物浓度，从而对临床的诊断和治疗形成一定的干扰，如果必须要饮水，不要大于150毫升，因为人体摄入150毫升以上的液体之后，会进行一次重新的调节，会导致人体抗利尿激素水平的分泌变化，从而导致尿量、尿液的浓度、代谢废物的浓度，都会产生调节。