真菌感染的灰指甲的治疗以系统用药为主，具体分析如下。
具有的药物使用情况需要根据患者的身体状况和病情等多种因素来选择不同的口服抗真菌药物。同时需要配合使用外用抗真菌药物，可以选择的药物包括阿莫罗芬擦剂。在用药后一段时间后，病情应当得到好转，如果病情未得到好转，需继续用药，并及时去医院检查病情进行针对性治疗。
灰指甲就是真菌感染引起的，因为真菌感染是发生在指甲内侧。真菌感染对灰指甲的传播是比较常见的，不过真菌是不容易从指甲里面漫出来的，另一个方面灰指甲是需要拔除指甲盖来治疗的，配合具有渗透性的药物治疗效果会比较好。
灰指甲多由红色毛癣菌、须毛癣菌、念珠菌等真菌感染引起。
当真菌进入指（趾）甲下方并开始繁殖时，会导致指（趾）甲增厚、变脆、变色（常见的是灰褐色或黄色）以及失去光泽。在某些情况下，感染还会导致指（趾）甲形状改变，变得不规则。如果不及时治疗，灰指甲可能会进一步发展，出现甲沟炎、甲床炎、嵌甲等并发症，引起疼痛和其他不适症状。
治疗灰指甲的方法主要采取局部外用抗真菌药物以及口服抗真菌药物，绝大多数患者可外用亮甲复方聚维酮碘搽剂这类外用抗真菌药，来达到杀灭真菌、抑制真菌再生的目的，改善灰指甲的症状。若病情较为严重，则可与特比萘芬等口服抗真菌药联合治疗，联合用药后的效果会比较显著。
灰指甲真菌感染可以口服和外涂药物治疗。由于自身免疫力差，真菌感染导致的灰指甲，不要吃辛辣食物，刺激性食物，一定要多注意卫生，多喝点温开水，多吃点新鲜青菜水果，多注意休息，多运动增强抵抗力。
可以口服抗真菌药物，具体用药谨遵医嘱，同时还要通过手术拔除病变的指甲。平时要注意手部卫生。灰指甲是由于真菌感染引起的，这个有可能会出现指甲凹凸不平，同时有可能还会出现指甲分层。
