对于预后较好的生殖性生殖细胞瘤，五年的存活率达到90%以上，即大部分生殖细胞瘤患儿可以康复，且不会复发。部分患者可能有约20%-30%的复发率。包括生理上的治愈和心理上的回归。对于生理上的康复，大部分生殖细胞瘤可以康复。
颅内生殖细胞瘤多由原始的生殖细胞衍生而来，在颅内多见于松果体区和鞍区两个部位。该病较难诊断。因此在影像学检查中怀疑为生殖细胞瘤时，建议进行脑脊液的生化指标检查，通过在手术中取得病理标本，便于确诊，进行相应的治疗。该病对放疗较敏感，治疗效果较好，部分患者放疗后，进行头颅CT检查时，可发现肿瘤明显缩小。
颅内生殖细胞瘤通常分为生殖性生殖细胞瘤和非生殖性生殖细胞瘤。对于愈后较好的生殖性生殖细胞瘤，五年的存活率达到90%以上，即大部分生殖细胞瘤可以治愈，且不会复发。部分可能有约20%-30%的复发率。治愈包括生理上的治愈和心理上的回归。对于生理上的治愈，大部分生殖细胞瘤可以治愈。
颅内生殖细胞瘤能活根据个人体质。肿瘤的大小和数目差别很大。他们可能伴有脑水肿周围病变，头晕，恶心，呕吐和其他症状。确诊后可进行手术治疗，如不能手术治疗可考虑放疗延迟肿瘤进展。如果有颅内高压的症状，甘露醇可以用来缓解症状。
儿童生殖细胞瘤，可能是病毒感染、物理因素等原因导致的。具体分析如下：
1、病毒感染：如果病毒改变了染色体基因的特性，使细胞原有增殖的特性发生改变，容易引起儿童生殖细胞瘤。
2、物理因素：如儿童受外伤或长期接触放射物质、化学物质，可能为诱发生殖细胞瘤素，瘤体的变化与接触放射物质紧密亲密相关，容易导致病情持续恶化。
一般情况下，小儿鞍上生殖细胞瘤是什么原因引起的，尚不清楚。
小儿鞍上生殖细胞瘤起源于第三脑室底部和垂体柄生殖细胞，临床主要表现为尿崩症、视力视野障碍、视丘下部-垂体功能紊乱以及颅内压增高。可能是第三脑室底部以及垂体柄生长压迫到视丘下部以及视交叉等附近组织，导致视神经附近会出现类似于肿瘤状病变引起的，还需要进一步研究确认。