主要的不良反应是腹泻，呕吐以及白细胞数目减少。还会导致结肠炎和胰腺炎，在肺部会导致出现呼吸困难最终变成呼吸衰竭。最主要的还是免疫系统功能下降，导致了容易被各种病菌感染，也会有的心肌炎的可能。可以通过定期检查的方法尽可能减少副作用的出现。
用药开始时应当注意监测血常规，肝功能，避免出现白细胞的降低，转氨酶的升高，另外要注意避免感染的发生。赛可平通常与激素合用，在与激素联合应用时，可以急速减少剂量。
可以长期服用，骨化三醇是抗骨质疏松治疗的一种药物。但是在服用期间应监测血钙和血肌酐浓度。因为存在一定的副作用，吃一段时间，停一段时间，然后再继续口服，这种药物是完全可以的。
骨化三醇是维生素D3经过肝脏和肾脏的转化后生成的1-25双羟维生素D3，是活性最强的维生素D，其作用为促进钙的吸收及减少钙的排泄，从而提高血钙浓度。阿法骨化醇则为骨化三醇的类似物，需要经过肝脏转化才能生成双羟维生素D3，其特点为作用缓慢，需要经过肝脏转化。
骨化三醇胶丸应早晨吃。骨化三醇胶丸是一种能够促进钙剂人体吸收的药物，其实际上是由维生素D3经过肝脏和肾脏的羟化酶双重代谢，而形成的1-25双羟维生素D3，是目前已知的抗佝偻病活性最强的维生素类药物。在临床上主要用于佝偻病以及绝经期妇女和老年性的骨质疏松症。
这两种药效果是一样的，不需要吃两种，吃一种就可以了，如果有比较明显的支原体感染的情况，可以吃罗红霉素，合并一些其他方面的炎症，症状，比较明显的话，也可以加用，同时吃了两种，一般对身体也不会有太大的影响。
