三个月宝宝睡觉老是摇头可能是缺钙、窒息缺氧病史等原因导致的。
1.缺钙：如果家长没有及时给三个月宝宝补充维生素D，可能会影响钙的吸收，容易导致缺钙，可能会引起神经兴奋性增高，导致睡眠不安，从而出现睡觉老是摇头的症状。
2.窒息缺氧病史：如果三个月宝宝出生的时候有窒息缺氧病，可能会影响正常的脑部功能，容易影响睡眠状态，从而出现睡觉老是摇头的症状。
宝宝三个月睡觉老是动可能是正常的生理现象，也可能是存在疾病。
一般来说，孩子在晚上睡觉时喜欢翻身，但是并没有出现任何的异常和不舒服的表现，说明孩子的身体状况并没有问题，所以妈妈们也不必太过担心。别看孩子这么小，但是他也会选自己喜欢的位置睡觉，有时候孩子也会做梦，有时候孩子会睡着了，他的腿会乱蹬，他的脑袋也会乱撞，但是他却不会感觉到疼痛。但是如果孩子出现大量出汗、晚上哭闹、烦躁、漏斗胸等异常情况，应考虑是不是缺钙。最好是到医院进行检查，进行相关的化验，如果孩子只是抽搐，没有出汗，也没有哭闹，也没有出现烦躁不安的情况，那就是很正常的情况。
一般情况下，宝宝三个月睡觉老是摇头可以是以下原因导致的：
宝宝三个月睡觉老是摇头，这就是维生素D和钙质的经典表现。缺乏维生素D和钙质的宝宝三个月会导致神经肌肉的兴奋，主要是由于汗腺的分泌增加，汗珠会刺激到头部，如果觉得痒，就会在枕头上来回的晃头，导致宝宝三个月睡觉老是摇头。还有就是睡眠浅、睡眠不安详，稍有一点声响就会惊醒，也会导致宝宝三个月睡觉老是摇头。
不可以的，婴儿趴着睡是引发婴儿猝死综合征的危险因素。原因有对于仰睡，婴幼儿趴着睡觉时通常睡眠较沉。出生3-4个月内的小婴儿学会翻身，但由于本身肌肉力量不足，尤其是控制头部转动的颈部肌肉较弱，趴着睡时，一旦口鼻被外物掩盖，不容易靠自己的力量把脸移开。
宝宝晚上不睡觉，可能是没吃饱。宝宝没吃饱就睡觉，是头几个月的婴儿不睡觉的常见原因。如果发现宝宝在床上翻来覆去，一直出现吸吮的动作，可能是因为没吃饱睡不着的。也可能是消化不良或腹胀的原因。
小宝宝睡觉摇头、手脚乱动是典型的缺少维生素D和钙的症状。缺钙的宝宝副交感神经兴奋，引起的腺体分泌增多、出汗多，汗液刺激宝宝头皮痒，这是宝宝摇头的原因，经常摇头可致头发脱落，形成枕秃。
