小脑脑干梗塞属于后循环梗死，可以采用药物抗血小板聚集治疗，口服或者是静滴改善脑代谢类的药物，也可辩证使用中医中药治疗。还需要结合病人的血管情况、病灶的大小、血压情况来进行血压的调控。
治疗的方法有，发病后4.5小时之内到达医院，确定诊断后可以应用静脉溶栓治疗，给予尿激酶100单位至150单位，静脉溶栓治疗。如果超过4.5小时，在6小时之内可以启动动脉溶栓进行治疗。经股动脉穿刺，将动脉导管放置在脑干血管堵塞处，给予尿激酶溶栓治疗是积极的治疗方法，在溶栓治疗后24小时或者不适合溶栓的病人，应该启动抗血小板治疗。
植物人，指的是植物生存状态相近的一种人体的生存状态。人的认知功能完全丧失，没有任何自主的活动，又叫不可逆的昏迷。临床上常常见于脑干损伤造成的症状，比如脑干出血，脑干梗死等。因为呼吸循环功能正常，皮层下的功能也是正常的，所以植物人在理论上可以长期的生存。生存的时间，和平时的护理息息相关，大部分病人可以存活数年，甚至十几年。
对于脑干梗死的病灶，它是不能够治好的。因为脑干梗死以后，它不能够恢复到和脑干梗死之前一样的状态，梗死以后，梗死病灶会被一些胶质细胞所替代，形成胶质瘢痕。但是患者是否能遗留后遗症，这需要看脑干梗死的位置、梗死的大小。
应当坚持用药，在配合中药和、理疗以及食疗进行缓解。平时应该多吃富含纤维素、维生素和矿物质等元素的食物，少吃含有高胆固醇、高脂肪和高热量的食物。适当进行体育锻炼。有利于促进血液循环，对缓解血栓有一定的作用。
