通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
骶管囊肿可以使用药物治疗，骶管囊肿（sacralcanalcysts）一般认为是先天性疾病，也有部分是后天获得的，属于硬脊膜内囊肿，以长期的慢性下腰部、骶尾部和会阴部疼痛为主要表现，骶管囊肿多数认为是一种先天性疾病，也有部分是后天获得的。
这样的病症是属于长于皮肤或是其他脏器内的囊性肿物，如果长的比较大的，会引起局部周围组织的疼痛或是功能性的障碍，这样的病症的治疗，主要是采用手术的办法进行治疗。人体会出现很多的囊肿，根据它的不同的部位和深度，可以分为体表的囊肿、空腔脏器的和实质性脏器的囊肿，从头到脚都可以出现囊肿，人们说的囊肿多是指皮肤出现的表皮囊肿和皮脂腺囊肿。
肝囊肿是否会生长是不可预测的。只能通过一次又一次的观察来判断。如果病人的囊肿没有生长，也没有给病人带来不适，那么就不需要治疗，继续观察是好的。如果有增长的迹象，那么就需要手术。必要时可以考虑局部切除肝脏组织。
囊肿最常见为肝囊肿、肾囊肿、皮脂腺囊肿或腱鞘囊肿。肝囊肿是肝脏比较常见的良性疾病，囊肿大多数为良性疾病。如果胰腺上有小囊肿就需要注意，其是否有恶性的可能性。
