牙根没拔干净会造成发育和感染，影响临近牙齿的健康。牙根没拔干净会妨碍拔牙创口的愈合，引起明显的疼痛和肿胀，演变成慢性炎症病灶，引起拔牙创口或全身其他部位的感染，如果长期不处理，即使消炎后缓解了疼痛，还有可能会出现根尖肉芽肿、根尖囊肿甚至可能出现颌骨囊肿，如果不修复，两侧的邻牙可能向缺隙处倾斜，对颌牙也可能向缺隙处伸长，从而会引起咬合关系紊乱。建议去医院进行x光片的检查，根据具体情况对断牙进行处理;近期饮食上要注意清淡。
智齿没拔干净会导致拔牙创口的继续损伤，造成牙龈发炎，引发口腔疾病。智齿没有拔除干净，如果剩余的是部分的牙冠或者牙根，并且牙根的长度多于2mm，会导致拔牙创的再次感染。如果滞留的是低于2mm的牙根，这种情况可以不用再继续进行处理。牙根有可能会和牙槽骨融为一体，或者有可能牙根会慢慢出现吸收，还有可能是牙根慢慢的会排出来，在口内表面浅表的位置。如果出现以后可以再次拔除，可以防止拔牙创的继续损伤，尽量把拔牙创的损伤控制在最小。但是如果高于2mm，或者有残冠留出就一定要清理干净。智齿位置特别深，残留根尖比较小，可以留置观察；如果残留根尖比较大，建议及时到医院拔出，否则可导致发炎。
费用一般是在300元-500元左右。智齿拔除术，在口腔颌面外科相对于普通的拔牙术而言，存在比较多的变异性，价格也各不相同。由于智齿本身变异比较多，因此在拔除的过程中难度也比较大。对于难度比较小的智齿，也就是已经完全萌出，不存在阻生，不需要对牙龈和牙槽骨进行切开，费用一般是在300元-500元左右。下颌相对贵，500元左右，上颌300左右就可以了。但是，很多下颌智齿存在阻生的情况，需要在拔牙之前对牙龈切开、牙槽骨去除才可以将智齿拔除，对于这类牙齿，拔除的费用一般在1000元左右。
拔牙时牙根没拔干净，断根处炎症加重可能会出现牙槽骨破坏、骨膜下脓肿、黏膜下脓肿等症状。如果拔的牙齿是健康牙齿，也就是根尖区没有明显炎症，断的牙根比较短一般没有太大影响。如果在5mm以下的残留牙根，根尖区没有炎症可以慢慢的自行吸收、消失。如果根尖区有炎症，炎症可能不一定得到控制，残留以后在身体抵抗力下降时可以慢慢发展，炎症加重出现牙槽骨破坏、骨膜下脓肿、黏膜下脓肿，也有可能根尖周围的炎症会变成根尖囊肿。断的牙根关键是看哪个牙，如果是在上下颌的智齿往往拔除比较困难，根尖又没有炎症，残留的比较少没有影响，如果在其它牙齿，断得比较长应该及时取出。建议大家平常要爱护牙齿，做到每天至少刷牙两次，定期去专业的口腔机构检查，如果要拔牙，请一定要到正规机构找专业的医生处理，千万不要为了贪图便宜而因小失大。
旦智齿根部留在里面，危害并不是很大，当创口长平时，剩下的根也都会再长出来，刚拔完创口，不能吃太烫的食物，拔除难度大的可以输头孢治疗，或者氯己定的漱口水消炎抑菌，也可以吃甲硝唑进行消肿。
可以去正规医院口腔科拍摄一张该牙齿的x线牙片，观察有无残根残留在牙槽窝里面，明确病因，采取进一步的方法。如果残根的长度长于3mm，要进行手术将其拔除掉。如果残根的长度短于3mm，可以口服消炎药物辅助治疗。
