系统性红斑狼疮的病因还不完全清楚，但是目前认为与遗传，感染，内分泌和环境等因素有关。遗传是红斑狼疮发病的重要因素，具有红斑狼疮遗传因素的人遇到环境中的诱发条件就会引发本病。
红斑狼疮是一种自身性免疫疾病，是由于体内中性粒细胞脱颗粒所造成的体内感染，有80%的控制良好，但是如果有系统性红斑狼疮，且发现较晚、不配合的话，很容易造成胸腔内脏器的损伤，十年的存活率可以达90%，更严重者，甚至只能存活5到6年左右。
红斑狼疮肾炎的原因主要为红斑狼疮形成的免疫复合物会沉积在肾脏，引起红斑狼疮肾炎。
红斑狼疮的患者容易形成比较多的免疫复合物，因为肾脏是作为排泄的器官，这些免疫复合物会通过肾脏进行排泄。如果在这个过程中，免疫复合物在肾脏各个部位形成沉积，如肾小管，肾小球，基底膜等部位，可能会导致狼疮性肾炎。但是红斑狼疮是否会导致肾炎是因人而异的。
儿童红斑狼疮发病初期会伴有轻微的瘙痒，但要避免搔抓引起皮肤破损，从而引起感染，因此建议及时治疗，避免搔抓。
小儿系统性红斑狼疮发病迅速，预后较差，属于侵犯多个系统的自身免疫性疾病。该疾病主要表现为体温升高、皮疹等，还可以侵犯泌尿系统、心血管系统、神经系统、血液系统等系统。患者颜面有红斑，长期暴露于阳光下会加重，上胸和手肘部位会出现红斑，还会出现皮肤出血和溃疡。建议尽早治疗，避免疾病加重。
怀孕可能会得红斑狼疮。
女性在怀孕的时候，体内的雌性和孕激素都会出现失调，如果是遗传易感基因，再加上长期的劳累、感染等原因，很有可能会引起机体的免疫机制紊乱，从而产生自身抗体，从而引起狼疮。即使孕妇患有红斑狼疮，只要不影响重要的内脏器官，都可以继续妊娠，但若出现肾脏、肺脏、中枢神经系统、心脏等重要脏器功能受损时，应优先考虑母亲的安全。
