阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
有部分男性的阴茎会比正常人要短，在进行性生活时，会引起影响夫妻双方的满意度。可选择手术治疗的方式来扩大阴茎的长度。通过切断阴茎上的短悬韧带和长悬韧带的，来将隐藏在体内的阴茎海绵体分离出来，从而达到延长阴茎的目的。
性生活时间只要不低于二分钟就是正常的，阴茎短小没有什么药物可以治疗。阴茎大小存在个体差异。勃起后长8-16cm，自然状态下长3-5cm，如果勃起小于8厘米，疲软小于3厘米就属于阴茎短小。18周岁生殖器就发育成熟了。如不满意，阴茎延长术是实现成年人阴茎延长的方法，只有手术来治疗。
阴茎短小能手术加长加粗，可以做阴茎加长术，还有自体脂肪填充术，使阴茎增粗。阴茎延长手术的过程比较复杂，通常可以延长3厘米-5厘米。
男人的阴茎短小变长很困难，这属于先天性发育问题，如果已经到了18岁，成年以后是没有好的办法可以改变的，只能通过手术矫正，也就是做阴茎延长术，但是手术有一定的风险，而且术后效果如何，也是因人而异的。
一般阴茎过了青春期以后就不会再发育了，一般只要勃起功能正常，可以正常完成性生活，就不需要特殊治疗。如果阴茎勃起状态下没有超过6厘米，就属于阴茎过短，会影响到正常的性生活，应去正规的公立医院做阴茎延长手术。手术可以使阴茎延长3—5厘米，但是手术会造成副作用，一般不应做手术。
