肛周脓肿早期可以用抗生素来控制进一步发展，但是如果已经形成脓肿了那就不是吃药的问题了，那就需要手术治疗了。可以做肛门镜检查，以明确具体诊断，方便进一步治疗。
如果是经过手术治疗之后复发了，那就得需要积极的进行治疗，防止这样的病症进一步的发展。可以选用一些抗菌消炎的药物进行治疗，也可以再加一些别的药物来联合进行服用治疗，合理饮食，均衡营养，饮食习惯上也要多注意少吃辛辣刺激性，过与油腻的食物，凉东西。平时注意保暖，避免感冒，加重病情。多喝水，少喝浓茶。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
肛周脓肿应该远离刺激性的食品和辛辣的食物，因为这些食物会导致肛周、直肠肛管的血管扩张，而不利于创面的愈合，也会导致瘢痕组织的增生。另外，刺激性的食物或者饮酒之后，也容易诱发药物的过敏反应不利于治疗。
肛周脓肿术后饮食根据肠胃肠道内环境来调控，不需要早期就控制饮食，建议做完手术后，恢复到正常饮食即可，比如可正常吃点米饭、蔬菜、肉食。早期时可适当控制，注意清淡饮食，海鲜、海产品、菌类，以及容易引起肠道不适的食物要适当控制，一般不需要对饮食有太强要求。
