如果宝宝大便中有果冻肠粘液，需要根据病因进行治疗。
一、非传染性疾病。宝宝的消化能力差，如果吃了太多的辅食，会导致宝宝的消化不良，如果宝宝有大便果冻状的粘液，可以服用益生菌、小儿保济口服液等助消化药物。
二、感染。宝宝的肠道免疫功能比较弱，容易感染细菌和病毒。宝宝感冒后，如果进食不干净的食物或者乳具不洁，就会有大便果冻粘液的现象，可以服用蒙脱石散。所以要注重宝宝的饮食习惯。
宝宝在患感冒的时候，会经常有大便果冻样黏液的症状。这种时候，要等着感冒治好了，大便果冻样黏液就好了。另外，肠道内感染的时候，由于奶具消毒不严格，导致病从口入，宝宝也会出现粘冻样大便。
生理因素是由于婴儿的肠道功能尚不完善，所以有些婴儿会出现胶状粘液大便。父母喂养婴儿的含淀粉食物，如过浓的奶粉、不适当的奶粉、奶粉中添加的糖、太冷的牛奶或过早添加的米浆等，很容易导致婴儿食物堆积，从而导致粪便中出现胶状粘液。
可能是肠道炎症引起的，如溃疡性结肠炎，痢疾，肠道肿瘤，慢性结肠炎，如果肠道表面有溃疡或炎症等病变，反复发作后，就会产生透明粘液或脓血，并随大便排出，应及时做电子肠镜、便常规的检查，以明确诊断。
婴儿大便有果冻状粘液需要排除一下是否由于细菌性痢疾导致出现的粘液便的情况，其次还要考虑是否有真菌感染。可能是由于轮状病毒感染导致出现的粘液便也不能完全排除，做一下全面的检查，治疗上主要是通过化验结果来决定选择药物的种类，如果细菌感染，则给予对症的抗生素如果是轮状病毒感染，主要要给一些抗病毒的药物。
如果长期拉肚子，出现透明粘液，可能是慢性肠炎或者结肠炎引起的肠黏膜脱落，可能形成透明样粘液便。如果是慢性结肠炎，可以在医生指导下口服美沙拉嗪或者是中药补脾益肠丸进行治。如果炎症感染严重，出现大便次数增多，可配合蒙脱石散进行治疗。日常生活中要注意饮食清淡，不吃生冷刺激的食物，减少对身体的刺激，通常能够缓解临床症状。
