多囊肝、多囊肾，治疗上主要以对症治疗为主，比如多囊肝、多囊肾的患者，如果出现了血尿，患者早期卧床休息，合并感染积极的抗感染治疗。如果囊肿过于巨大，而产生了压迫的症状，比如多囊肾出现腰部的疼痛，肝囊肿出现上腹部的疼痛，这时如果有单个的囊肿比较巨大，可以行去顶减压术，来减轻患者的这种疼痛不适。出现了肝功能的异常或者肾功能衰竭，对症的使用保肝类的药物、保肾降糖类的药物对症治疗。
食谱要采用低盐饮食每天2～3克食用盐为宜，少吃含钾、磷，饮食，要低蛋白、低脂肪饮食、多吃富含维生素与植物粗纤维饮食，可以做黄芪烧羊肉，扁豆薏薏米田鸡汤，熟地枸杞子炖鳖鱼汤等。
多囊肾是由于人体正常的肾脏逐渐被囊肿所替代形成，多囊肾的表面满布大小不等的囊肿，其体积比正常肾脏明显增大。临床上多出现囊内出血、囊内感染、多囊肾结石等情况，患者主要表现为腰部疼痛、腹部疼痛、发热。
多囊肾饮食禁忌，动物的内脏作成的熟食不适合多囊肾的饮食，特别是动物肝脏，如果病人服用这些物质后无形对肾脏增加负担，加重病情。还要注意酒类饮料，酒类、特别是白酒，对于多囊肾的饮食来讲宜戒掉，酒类对与肾脏的刺激性优为重要。它可以刺激多囊蛋白活性，加速囊肿生长。
保守治疗，一般多囊肾处于早期，若出现相关临床症状，可做对症处理，如减少囊液分泌、降低血压或者采用一些结合的药物，来缓解患者的症状；手术治疗，多采用囊肿去顶减压术治疗，即把肾脏囊肿单独打开，降低对周围正常肾组织的压迫，保护正常肾组织的功能。
