这种药物有一定的副作用。丹参不可以长时间服用，长时间服用丹参会刺激胃肠，会导致一定程度的泛酸症状。有胃肠疾病或者癌症都不可以长时间服用丹参。丹参也具有抑制血小板聚集，降低血黏稠度的作用。
基本可以说没有，数十万患者中，仅有部分因个体差异出现过一过性头胀、头晕或脸潮红，极少数会有胃肠道不适。丹参酮是从丹参中提取的，用于痤疮、扁桃腺炎、外耳道炎，有抑菌作用，有抗菌，消炎，促进伤口愈合，降温等作用。
少数可出现低钾血症，会有精神倦怠，反应迟钝，嗜睡，甚至昏迷等多种症状。丹参也可引起过敏反应，表现为全身皮疹，瘙痒，荨麻疹有时还伴有胸闷，呼吸困难，恶心，呕吐等症状。
如果不是长期服用的话，对肝脏没什么副作用的，长期服用的话，会对肝脏造成负担。服用需要注意事项有，丹参不可和阿司匹林一起服用，有胃肠疾病的人服用丹参时可加服陈皮、鸡内金、白扁豆等健胃。
复方丹参滴丸长期服用会存在一个问题，组方中的冰片很容易引起肠胃损伤，比如胃炎、胃溃疡等，尤其是脾胃虚寒的患者更不适合长期服用。常见同类药物中，麝香保心丸组降低了冰片的含量，长期使用不伤胃，适合长期服用。
