孢子菌感染可以口服药物来治疗，然后用药物清洗，如果被感染部位有瘙痒的症状，瘙痒时千万不要剧烈的去抓挠它，以免引发进一步的感染，平时一定不要抽烟，不要喝酒，以免加剧病情的变化。
肺孢子菌肺炎也叫做卡氏肺孢子虫肺炎、卡氏肺囊虫肺炎，主要是由于感染肺孢子菌引起了间质性肺炎，是一种条件性肺部感染性疾病。开始时出现干咳，迅速出现高热、气促、发绀，可有肝脾大，进行肺部查体多没有特殊表现，可并发艾滋病引起呼吸衰竭。
糠秕孢子菌毛囊炎即马拉色菌毛囊炎，可以通过局部外用涂抹药物、口服药物的方法进行治疗，对于改善皮肤长丘疹的症状可以起到一定的帮助作用。
1.局部外用涂抹药物：可以在医生的指导下，合理的使用盐酸特比萘芬乳膏、盐酸阿莫罗芬乳膏等药物进行治疗，这些药物通过改变真菌细胞膜从而达到抑菌的作用。
2.口服药物：除了通过在局部涂抹药物以外，还可以遵医嘱使用伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等药物进行治疗，可以起到抗真菌的作用，能够有效的杀灭真菌。
是由马拉色菌引起的毛囊炎症.适宜条件下，马拉色菌在毛囊内大量繁殖，其脂肪分解酶将毛囊部位的甘油三酯分解成游离脂肪酸，后者可刺激毛囊口产生较多脱屑并阻塞开口，使皮脂潴留，加之游离脂肪酸的刺激，致毛囊扩张破裂，导致毛囊内容物释放入周围组织产生炎症反应。
多饮红茶。红茶中有各种抗菌作用，并且预防感冒。红茶中黄酮类化合物具有杀除食物有毒菌、使流感病毒失去传染力等抗菌作用。宜凉血解毒食物。绿豆、粳米、黄瓜、苦瓜、马齿苋、绿茶等。多食用清热类食品。如绿豆，清热解毒，丝瓜，凉血解毒。忌咖啡等兴奋性饮料。忌葱、姜、桂皮等辛辣刺激性食物。忌烟、酒。忌肥腻、油煎、霉变、腌制食物。
糠皮孢子菌毛囊炎，是由糠皮孢子菌引起的毛囊炎症，糠皮孢子菌属于真菌的一种。糠皮孢子菌毛囊炎的诊断主要是和细菌性毛囊炎进行鉴别，细菌性毛囊炎炎症比较明显，对于抗生素治疗有效果，而糠皮孢子菌毛囊炎的炎症较轻，对于一般的抗菌治疗无效。临床上可以取毛囊炎内容物涂片检查，发现孢子即可诊断。
