乳腺囊肿可以通过手术或病理穿刺来治疗。
由于乳腺囊肿是乳腺的良性肿瘤。通过手术切除，是可以完整的切除，不会引起复发或其他病变。而穿刺治疗适用于不宜手术切除的病例，也是有治疗作用的。
建议患者在日常生活中注重个人的饮食，不要食用生冷、辛辣等食物，多吃新鲜蔬菜，饮食清淡，禁烟禁酒，注重锻炼，保持愉悦心情。
去除乳腺囊肿的方法主要有服药疗法和手术疗法两种。
一般来说，乳腺囊肿还没有2cm的时候，可以考虑使用药物进行治疗,用中药或者中成药都是对较好的，当乳腺囊肿到达2-5cm时候可以采用抽取囊液的方法进行治疗，当在乳腺囊肿大于5cm时后,可以采用微创手术的方法进行治疗。
建议患者需要规律生活，保持心情舒畅，养成良好的运动习惯。
避免辛辣刺激性食物的摄入，避免摄入油炸类食物。避免进食由饲料喂养的鸡、鸭、鹅、牛、羊等肉类，因为它们的肉中可能残留动物性激素。避免进食动物的内脏，因为含有大量的胆固醇。可以平时多吃蔬菜、水果，含有维生素C、E丰富的食物。保持心情舒畅，忌烟、忌酒。
乳腺囊肿是良性肿瘤，极少引起癌变。乳腺囊肿是内分泌紊乱引起的导管部位内液体增多，从而出现囊肿。囊肿如果逐步增大，会对周围组织造成压迫，使该器官功能异常。其治疗方法西医一般采用手术治疗，抽取其囊内液体使其萎缩。
乳腺囊肿通常不会消失。乳腺良性病变，一旦发现应考虑手术切除。乳腺囊肿主要是由于内泌紊乱引起导管上皮增生，管内细胞增多，致使导管延伸、迂曲、折叠，折叠处管壁因缺血而发生坏死，形成囊肿。乳腺囊肿常见的有单纯囊肿、积乳囊肿等。单纯囊肿在乳腺囊肿中最为多见。
