增强核磁共振造影剂的危害主要是可能会发生血流动力学改变。有可能会引起碘过敏反应的危险，轻度的过敏反应仅表现为恶心、呕吐等，中度表现为喉头水肿、呼吸困难、荨麻疹等。
比较常见的副作用例如恶心、呕吐、红斑、疼痛和温热感较常见，一般在三、五天基本消失，但是对比剂多为含碘制剂，部分人会有一定的过敏反应，过敏反应常见有注射药物后出现心悸、寒战等，严重者甚至过敏性休克等，需要立即抢救。
大约2000左右，在一般的三甲综合医院，脑组织的磁共振增强费用包括行磁共振扫描的费用，增强用药的费用以及高压注射器等注射用材料的费用等几部分，脑部的增强脑灌注检查可能也是需要2000多块钱。
做CT增强，所用造影剂基本上都是非离子型阳性造影剂，以碘海醇用的最多，碘海醇的商品名有欧乃派克、欧苏等。通过静脉注射到体内的碘海醇，于24小时内几乎全部药物以原形经尿液排出。注射后一小时，尿液中浓度最高。无代谢物产生。
造影剂在临床增强检查中是经常使用的，对人体的副作用不是很大，使用之前先做过敏试验，它的副作用是容易引起过敏，所以做检查之前应该消除紧张的心理建议，造影剂是靠肾脏代谢的，所以做完之后，要求多喝水，勤排尿，来把造影剂代谢出去。
磁共振和增强磁共振有区别。磁共振是直接核磁平扫，增强核磁共振是用造影剂后进行平扫这两者的去别在于，磁共振只能看到组织，而增强核磁共振对组织肿块进行检查更加彻底。
