较小的根尖囊肿可以通过根管治疗后定期复查，若有变小，则不需要另行处理；较大的根尖囊肿则需要在根管治疗后，进行根尖手术、囊肿切除术。大的根尖囊肿需要进行手术切除，囊肿部位的牙齿能够保留的尽量保留，不能保留的也需要一并拔除。
考虑根尖囊肿，慢性炎症引起的，这种通过消炎肿胀可能减轻，但囊肿不会吸收，需要手术切除，否则会继续破坏骨质。现在暂时看消炎药可以缓解肿疼，但是这个病如果要治好还是手术比较好。
牙根尖发炎是不可以靠自愈的，处理方式是以根管手术为主。首先需要做一个牙齿拍片检查，需要观察是哪一个位置导致的炎症，其次进行局部麻醉，用钻开牙齿，祛除牙齿里面腐败的牙质，打开牙髓腔，祛除坏死的牙髓，再用根管钻扩大根管，用消毒液清洗根管内部，使用专门的材料填充根管。
有慢性牙根尖炎。应先杀死牙神经。患处应该消炎换药医治，再配合静脉输液。抗炎医治。勤漱口，保持口腔清洁。吃柔软易消化的食物，避免生冷硬凉以及辛辣刺激性食物。根管医治是需要一定时间的。注意休息，避免过度疲劳，吃软易消化的食物，避免生冷硬凉以及辛辣刺激性食物，勤漱口，保持口腔清洁。
早期有轻度的疼痛感，此时患牙如果咬紧，疼痛可以暂时缓解，随着炎症的加重，患者自觉牙齿伸长感，咬合时先接触。有比较明显的咬合痛。疼痛性质为自发性，持续性疼痛，范围局限，患者能够明确指出哪一个牙齿是患牙。如果此时没有得到及时治疗，炎症继续发现，就出现了急性牙根尖炎的症状。
