较小的根尖囊肿可以通过根管治疗后定期复查，若有变小，则不需要另行处理；较大的根尖囊肿则需要在根管治疗后，进行根尖手术、囊肿切除术。大的根尖囊肿需要进行手术切除，囊肿部位的牙齿能够保留的尽量保留，不能保留的也需要一并拔除。
胶样囊肿为一种先天性疾病，甚少见。最常见的临床病症是头痛，垂体内分泌功能障碍及视功能障碍。所以这种如果需要进行手术，还是需要进行敞开，这样病情才能够比较快的恢复，而且病情存在一定的复发概率。
肝囊肿并不是非常严重的一种囊肿，一般可以通过简单的治疗。但是对于囊肿不是特别大的患者来说，可以不需要治疗的，只需要定期的做彩超的随访和观察，观察囊肿是否有增大的可能性。
而对于囊肿比较大，患者已经出现明显的压迫症状以及肝功能改变，此时说明病情加重，建议遵医嘱进行穿刺放液治疗和保肝治疗，严重时也可进行手术治疗。
脚背腱鞘囊肿可以采取以下办法进行缓解。
足背的腱鞘囊肿是一种比较常见的劳损性病症，它是由于足部伸肌腱腱鞘及周边的纤维组织发生退变所引起的囊性病变，在重复运动的过程中会慢慢生长，早期的腱鞘囊肿可以采用包囊挤压的方式将其挤溃，然后进行局部的按摩，避免复发。如果无法缓解，建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。