治疗上首先就是局部清洗，要翻转包皮彻底清洗，对于包茎者可考虑包皮环切术，使龟头自然显露。对于长期不愈的患者，应该查一下梅毒、艾滋病等除外性传播疾病。取溃烂组织作病理检查。
针对溃烂部位的皮肤组织，首先要做的是防止继发感染，患者应在医生的指导下用生理盐水清洗，外用抗感染药物，以防止伤口进一步感染或恶化。
皮肤溃烂多是由于外伤、微生物感染等因素引起的，首要的是用温水清洁溃烂的皮肤，去除污垢和细菌，并保持创面的干燥。随后，患者可以遵医嘱在伤口上使用适当的湿敷剂或药膏，以促进愈合和细胞再生。常用的药膏有京万红软膏，该药膏对金黄色葡萄球菌、白色念珠菌、乙型溶血性链球菌、绿脓杆菌、白色葡萄球菌、大肠杆菌等细菌均有较好的抑制作用，可以预防皮肤溃烂感染，同时具有去腐生肌之功效，能够去除溃烂处的腐皮，帮助新生肉芽生长，促进创面的愈合。
良好的营养有助于皮肤愈合，患者在治疗期间应保持均衡饮食，摄入足够的蛋白质、维生素和矿物质，以加快病情的好转。
可以口服抗菌感染的药物来进行缓解，也可以配合消炎的药膏进行涂抹，治疗期间要注意局部的外形保持干燥卫生，勤换内衣。包皮溃烂多数都是由于包皮龟头炎引起的。
由于导致引起外阴溃烂的原因不同，所以治疗方法会有所差异。根据不同病因的外阴溃烂，进行特异性全身以及局部的治疗。药物的治疗以抗真菌、抗病毒、抗结核、抗霉菌等治疗。局部的治疗，保持外阴的清洁、干燥，可用适宜的药物坐浴治疗。皮损处涂药，针对不同病原体，可以选择不同的药物，还有局部的理疗有助于外阴溃烂的愈合，也可以用物理疗法。
导致男性生殖器皮肤溃烂的原因有很多。根据发病原因不同，临床可以采取一般治疗、药物治疗。
当患者局部卫生处理不当时可形成大量包皮垢，包皮过长的患者建议进行环切术来防止病情复发，日常注意个人卫生清洁到位，对私人用品进行消毒处理。或者使用如氟康唑胶囊、阿昔洛韦片等药物治疗。
通常情况下，冻疮引起的溃烂可以理疗或者药物治疗。具体分析如下：
冻疮是由于气候寒冷引起的局部皮肤反复红斑、肿胀性损害，严重者可出现水疱、溃疡，如果患者是冻疮引起的溃烂，可以用氦氖激光等理疗方式来配合治疗，同时要注意保持局部皮肤的干燥清洁，避免皮肤感染发生。可以使用药物来治疗，比如重组牛碱性成纤维细胞生长因子外用凝胶、鱼石脂软膏，红霉素软膏或者莫匹罗星软膏等。
