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肠镜跟胃镜相比难受的状况还是要看个人的耐受程度，一般肠镜前期准备工作难受点，一开始就要喝泻药然后不停的拉肚子，直接拉水状为止。检查过程中管子由肛门进入检查。而胃镜的前期准备无痛苦，但是检查时管子由口里进入，主要是恶心的难受而不是痛。
一般来说，胃镜的检查痛苦相对较重，具体分析如下：
随着医疗技术的发展，现在胃镜和肠镜的检查均可进行无痛操作，也就是在麻醉的状态下对患者进行检查。患者并不会出现明显的不适感。也就不存在肠镜和胃镜哪个更难受的情况。但是如果采用常规的肠镜和胃镜检查，因为没有麻醉和检查方式不同的原因，胃镜的检查痛苦相对较重。
胃镜和肠镜能同时做。
胃镜和肠镜是可以同时做的，清理肠道后要注意不要吃东西，4个小时以后再进行胃肠镜。胃镜检查时患者左侧卧位口咬牙垫，然后用胃镜观察十二指肠和食管的粘膜。结肠镜是通过结肠镜从直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，一直到回盲区，对所有结肠的粘膜进行检测。检查后患者平时多休息，不要劳累，同时也要保持合理的饮食，不要吃刺激和油腻的食物。
相比胃镜，肠镜检查更加痛苦。一方面由于肠道走形更加多变，长度更长，因此检查所需的时间较胃镜更长，有可能需要半小时，而胃镜仅需要5-10分钟。另一方面在肠镜检查的过程中，还需要不断的注入空气或生理盐水，因此可能会持续出现腹痛、腹胀的情况。
胃镜和肠镜不是同一个仪器，胃镜一般直径较细些，大约0.8cm，肠镜直径粗些，一般1.0cm多些。胃镜和肠镜不但粗细不同，而且长度，消毒槽以及活检钳，检查室，包括检查目的和部位均不同。
考虑患者有胃炎、肠炎，检查胃镜和肠镜是正确的，检查胃镜一般要求空腹，肠镜要清理肠道。正常来说可以先检查肠镜，然后在检查胃镜。少量的喝水对于胃镜影响不是很大。一般检查时间和最后喝水时间有一定的间隔，所以影响不是特别大。有一起检查的。影响会有，不过不是很大。可以一起检查。