沙眼衣原体尿道炎能根治。
沙眼衣原体尿道炎属于是非淋性的尿路感染，大多数是可以治好的，要积极配合医生进行治疗。确诊后，患者需要遵医嘱采用广谱抗生素治疗，并且要规则、定量、彻底治疗，要连续不间断用药，才能够达到根治的效果。患者还要做好日常护理，保持局部清洁卫生。
沙眼衣原体是男性尿道的常见致病菌，潜伏期1～3周，临床表现为尿道粘液性或粘液脓性分泌物，并有尿痛、尿道不适等症状，急性发作时尿道口发红的，可以提取分泌物进行化验，选择敏感的抗生素，在药物治疗的同时，要保持个人的清洁卫生，大量饮水，在药物治疗的同时，最近的饮食要以清淡为主，不可以吃辛辣刺激性食物。
沙眼衣原体感染主要通过药物进行治疗。
衣原体是介于细菌与病毒之间的微生物，可感染眼、鼻咽部、子宫颈、尿道黏膜等部位。感染后常见病包括沙眼、结膜炎、泌尿生殖道感染等，衣原体对阿奇霉素、多西环素、四环素或红霉素比较敏感。但是用药剂量需要根据患者具体情况而定，并遵医嘱服用药物。
沙眼衣原体抗原检测阳性，需要口服抗生素治疗，应该保证足疗程，抗生素药物在治疗生殖器衣原体感染的治疗率可以达到90%以上。衣原体还没有出现在抗生素耐药性，所以病人在治疗时不必担心耐药的问题，多参加体育锻炼，提高自身免疫力，注意在患病期间不要同房以免交叉感染。
沙眼衣原体感染的治疗目的是治疗感染，防止产生合并症，阻断进一步传播。治疗原则是早期发现早期治疗，足疗程足量用药，性伴侣须同时治疗。要勤洗澡，不提倡洗盆浴，衣物要单独存放；要经常换洗内裤，特别是新内裤或长久不穿的内裤，穿之前要清洗晾晒；穿透气好、吸湿性强的棉织品内裤，尽量少穿紧身裤或牛仔裤，多穿透气性好的裙装，这对保护女性身体健康是非常重要的。