半夜头疼疼醒可能是丛集性头痛，大多数发生于20岁-40岁青壮年，是一种神经血管性头痛，确切病因目前尚不明确，大多数人夜间发病，多数于入睡后1小时-2小时发病，通常为持续性的钻痛，疼痛剧烈难忍。
腰疼脚疼腿疼的原因如下：
一、腰椎疾病，比如腰椎管狭窄、腰椎间盘突出等，主要是由于压迫了下肢的坐骨神经而导致的，主要表现为腰痛向下肢的后方或者是外侧放射，还可能伴有肢体麻木，肌肉力量降低等。腰椎核磁共振检查可确诊。
二、风湿性结缔组织病。常见的是受风感冒后会有腰、关节僵硬的症状，可以通过抽血来帮助确诊，如果腰腿疼痛，需要到医院的骨科门诊进行检查。
小腹右边疼，要考虑是不是得了阑尾炎。如果是右上腹有触痛，或者是出现了进展性的右上腹痛，都是急性阑尾炎的表现。
此外，小腹右边疼不一定是得了阑尾炎，也有可能是胃肠炎、肾结石等。其次是附件炎、卵巢囊肿、蒂部扭转等疾病。
如果月经延期，而且感觉到了小腹右侧有明显的疼痛感，也有可能是异位妊娠导致的。
要见于体内受到病原体的入侵，引起呼吸道黏膜的炎症反应。咳嗽动作过于频繁而剧烈，而引起腰部肌肉的牵扯疼痛。另外需要考虑由于感染溶血性链球菌而引发急性肾小球肾炎。
主要是由于患者发生了神经性的头痛。因为日常生活当中，精神过度的紧张，压力过大或者过度的劳累，以及在睡前吃了辛辣刺激性的食物，都会出现睡觉半夜头痛的症状。另外，也常常见于偏胖的患者，在睡眠的过程当中打鼾，这时气道会出现反复发生低通气的状态，严重的还会出现呼吸困难。
