一般来说，停经40天b超看不到孕囊的主要原因是以下这些：
1、月经不正常、受孕晚，有的女人月经不规律，一般要40多天才来一次，这个时候，即使检测出来了，受孕的时间也比较晚，在子宫里见到孕囊的时间也比较晚。
2、可能是因为子宫外孕，也可能是因为妇科的炎症，比如输卵管炎。B超检查没有发现孕囊，有阴道出血、腹痛等症状患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
通常情况下，停经40天看不到可能是检测过早。宫外孕导致的。具体情况分析如下：
在怀孕早期，孕囊可能还没有发育，但也有可能是因为宫外孕早期，并没有发现孕囊。建议女性在一周后到妇产科做盆腔超声，确定孕囊的发育，同时还可以去医院做HCG和血孕酮检查，看看有没有孕激素不足，如果孕激素下降，可以在医生的指导下口服黄体酮类的药物来改善。
怀孕40天看不到孕囊可能是以下原因导致的。
女性在40多天内看不到孕囊主要是因为女性的生理周期不正常，月经周期比较长，如果孩子的年龄还不到40天，建议等7个星期做一次B超检查。如果胎儿还没有长出，需要等7-10日后再进行检查。也有可能是宫外孕，检查HCG的数值，每两天做一次检查，说明有可能是子宫内怀孕。孕囊和卵黄囊是在妊娠42周进行的，而女性要进行阴道超声，可以在3-5天内看到孕囊和卵黄囊。
如果平时月经周期是规律的30天一次月经，停经40天的时候经过B超检查仍然看不到妊娠囊，但是血HCG阳性的情况下，临床上一定要排除宫外孕的可能性。隔一天再抽血检查一次，了解血HCG是否在原来的基础上出现翻倍上升。
宫外孕一般指异位妊娠，孕45天看不到孕囊，又不是异位妊娠建议再仔细进行检查以明确是什么原因，具体分析如下：
孕45天看不到孕囊，又不是异位妊娠，需要做B超检查。大多数异位妊娠发生于输卵管妊娠，但是很少发生于上一次剖宫产切口妊娠或腹腔内的妊娠。如果这些情况都能排除，需要复查血HCG水平来判断是否已经流产，如果HCG水平恢复正常，说明患者已经完全流产，不需要特殊处理。
停经40天的时候经过B超检查仍然看不到妊娠囊，但是血HCG阳性的情况下，要排除宫外孕的可能性。隔一天再抽血检查一次，了解血HCG是否在原来的基础上出现翻倍上升。如果没有翻倍上升，只是上升一点点则高度怀疑宫外孕。
