较小的根尖囊肿可以通过根管治疗后定期复查，若有变小，则不需要另行处理；较大的根尖囊肿则需要在根管治疗后，进行根尖手术、囊肿切除术。大的根尖囊肿需要进行手术切除，囊肿部位的牙齿能够保留的尽量保留，不能保留的也需要一并拔除。
考虑根尖囊肿，慢性炎症引起的，这种通过消炎肿胀可能减轻，但囊肿不会吸收，需要手术切除，否则会继续破坏骨质。现在暂时看消炎药可以缓解肿疼，但是这个病如果要治好还是手术比较好。
牙齿根部的囊肿可以手术消除。如果没有任何的临床症状出现，不需要做特殊的处理定期的去医院观察就可以了。相反有症状出现，去医院选择手术把它切除。正常的恢复可能需要两到四周的时间。
腹围增粗、腹内肿物，如肿瘤没有并发症，极少疼痛。因此，卵巢瘤感觉腹痛，尤其忽然发生，多系瘤蒂发生扭转，偶或为囊肿破裂、出血或感染所致。一侧卵巢甚至双侧卵巢囊肿，由于并不破坏所有的正常卵巢组织，故多半不引起月经紊乱。巨大的卵巢囊肿可因压迫横膈而引起呼吸困难及心悸，卵巢囊肿合并大量腹水者也可引起此种症状；但有的卵巢囊肿的呼吸困难是由一侧或双侧胸腔积液所致，并且往往合并腹水。
根尖囊肿如果发生肿痛现象，多数是属于慢性牙槽囊肿发炎的症状。这种炎症如果不及时治疗，有可能炎症加重后会引起牙髓炎，而且也极有可能会引起牙槽骨的脓肿加重。建议及早就诊，早些治疗。
