通常情况下，头部百会穴痛可能是疾病导致的。
头顶部百会穴发生疼痛症状，若有打喷涕、流鼻水症状，很有可能与发烧感冒相关。头部百会穴痛也有可能与毛细血管紧张性疼痛相关。通常与紧张焦虑、工作压力、恼怒、激动、热冷刺激性、严重休息不好、劳累过度等相关。疼痛比较严重时，伴四肢麻木、活动受到限制症状。很有可能与出血性脑血管疾病，或脑缺血脑血管疾病、大脑供血不足、缺血性、氧气不足造成的疼痛和颅内压升高等相关。应当在医院体检明确发病原因后再医治。
可服用药物治疗；也可采用，针灸，中药调理，心理疏导等方法治疗。平时应注意低盐低脂饮食。避免喝酒抽烟。避免吃辛辣刺激性的食物。注意劳逸结合。保持良好心情。避免情绪过度波动即可。
一般情况下，百会穴疼的原因有以下几种：
百会穴疼的原因有高血压、脑血管痉挛、脑供血不足等人体的一些全身性疾病。同时偏头痛、神经痛等头部局部的一些病变，比也会引起百会穴疼痛，需要及时治疗。
在治疗期间，建议患者注意合理安排休息时间，以清淡、易消化的饮食为主，适当进行户外体育锻炼，注意保暖，有利于身体的健康。
造成头部痉挛疼痛有很多种情况，可考虑为下列原因造成，首先可为近期精神过于紧张、学习或生活压力过大、思虑过多所致，此种情况可对头部血管造成极大刺激而产生头部痉挛疼痛。
其次，可因血糖不稳定或血脂偏高所致，这通常与不健康饮食习惯如摄入过多高脂肪刺激性油腻食物等有关。还可能是患者的其他不良习惯引起的，需及时纠正。
在头顶正中心，以两边耳尖划直线与鼻子到后颈直线的交叉点，或以两眉头中间向上一横指起，直到后发际正中点。此穴为人体督脉经络上的重要穴道之一，是治疗多种疾病的首选穴。
一般情况下，百会穴长白头发，可能是肾阳虚导致的，患者可以采取药物治疗、日常护理等方式进行治疗，缓解相关症状。具体内容如下：
1.药物治疗：如果患者百会穴长白头发，可能是肾阳虚导致的，患者可以及时前往正规医院，在医生指导下使用金匮肾气丸、四神丸、真武汤等药物进行治疗。
2.日常护理：患者还要注意休息，不要过于疲惫，性生活不宜过于频繁，可以适当进行运动锻炼。