如果囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤，多为功能性囊肿，可以2-3个月检查一次，以后再调整检查间隔时间。若囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢肿瘤，需要手术治疗。而手术治疗，可以选择宫腹腔镜微创手术。
通常来说，半夜四点多被肚子痛醒可以通过药物治疗、一般治疗等方法进行处理。
半夜四点多被肚子痛醒需要到正规的医疗机构进行诊断，如果暴饮暴食导致腹泻而造成的，可以服用颠茄片来减轻疼痛；如果出现腹痛、肛管不畅等表现，可能是肠阻塞，需要根据粪便状况进行相应的处理；如果女性突然腹部剧痛，需要根据经期来判断，若是月经来潮导致的，注意热敷腹部即可。
囊肿大于5厘米是需要考虑手术治疗的，现在最常用腹腔镜手术，是微创的，损伤小，术后恢复快。盆腔的手术建议在月经干净后去医院住院，要先完善相关的检查，再进一步安排手术的日期。
卵巢囊肿分很多种，如果是生理性的，属于正常现象，不需要做特殊的处理，但如果是病理性的，就需要做手术。生理性的囊肿，包括卵泡、黄体，小于5cm，以囊性为主。但如果是病理性的囊肿，指直径大于5cm，或者持续存在三个月左右。
考虑卵巢囊肿，主要是由于遗传或内分泌紊乱，饮食及环境因素，长期过度焦虑紧张导致。建议保持会阴部清洁，避免情绪过度焦虑紧张，必要时手术切除治疗，饮食清淡，不吃辛辣刺激之品。
这种疾病属于一种良性的占位性疾病的，一般是没有大问题的。属于中等大小，也可以先观察的，如果以后有增大，就可以考虑手术治疗，也可以先试试用药物看看能不能消退。保持会阴部清洁，避免情绪过度焦虑紧张，必要时手术切除治疗，饮食清淡，不吃辛辣刺激之品。
