贲门肿瘤的早期症状为：出血：食管癌、贲门癌有时也会呕血或便血，贲门癌的肿瘤可浸润大血管而发生致命性大出血。疼痛：胸骨后或背部肩胛区持续性钝痛，表示贲门癌的癌外侵，引起食管周围纵隔炎，贲门癌引起的疼痛也可以发生在上腹部，应注意贲门癌的肿瘤有穿孔的可能。
早期贲门癌是没有什么明显的症状。即使有一些症状也和普通的上消化道疾病，比如胃炎、胃溃疡、反流性食管炎的表现，比如腹胀、隐痛、嗳气等没有明显的区别。中晚期的贲门癌，临床症状和食管癌比较相似，典型的表现就是进行性吞咽困难。
贲门癌晚期随着病情的进展，临床表现多种多样。由于贲门属于胃入口，该区域发生病变，可以引起梗阻，严重时出现不能进食、进水，在临床上贲门癌晚期多以消耗为主要表现，出现恶病质，常处于饥饿的状态。肿瘤穿透可引起穿孔、破溃引起大出血，甚至死亡。
贲门癌晚期症状不一样，如出现一些合并症，出血或穿孔，这是严重合并症，可能会短时间内导致患者去世。还有肿瘤导致的梗阻，导致进食困难，人会逐渐消瘦，营养消耗比较严重，最终出现多器官的功能衰竭，就是心肝肺肾功能慢慢衰竭。
咽下困难进行性咽下困难是绝大多数患者就诊时的主要症状，但却是本病的较晚期表现。因为食管壁富有弹性和扩张能力，只有当约2/3的食管周径被癌肿浸润时，才出现咽下困难。因此，在早期症状出现后，在数月内病情逐渐加重，由不能咽下固体食物发展至液体食物亦不能咽下。
