进行康复治疗，首先要针对神经系统功能障碍进行积极的康复。主要是进行坐位平衡，站位平衡的训练，包括对瘫痪肢体的，被动和主动锻炼。当然是在康复医生的指导下进行系统训练。如果出现饮水呛咳，需要进行吞咽功能的康复训练，吞咽功能的训练，可能时间也会很长，同时可以配合针灸等方法进行治疗。
脑血栓后遗症主要通过药物治疗和康复功能锻治疗来进行。药物治疗主要是使用具有活血化瘀、芳香开窍疗效的中西药防止血栓复发。康复功能治疗则是配合按摩理疗等辅助手段，逐渐改善血循环状况。脑血栓康复治疗是一个长期的过程，必须持续用药和锻炼。
脑血栓后遗症的康复治疗其实不算是很贵，但是以长期治疗为主，一般康复治疗，大概两年，而且两年之后建议每年定期进行康复理疗，促进血液循环。治疗的单次费用一般是几十块钱到几百块钱左右，而每次治疗1~2个疗程左右就可以。
一般来说，脑卒中脑血栓可以通过头颅CT或核磁共振确诊，具体如下：
脑卒中又名脑中风或脑血管意外，是一种突然起病的脑血液循环障碍性疾病，通常会伴有一侧肢体无力、笨拙、沉重或麻木，一侧面部麻木或口角歪斜等症状。脑血栓患者也会出现头晕、头痛、肢体麻木、口舌歪斜、言语不利等症状。此时，可及时前往医院，进行头颅CT或核磁共振检查，一般能够确诊。
在日常生活中，患者应保持愉快的心情，防止情绪激动，可适当参加体育锻炼，饮食应注意补充营养，保证营养均衡。
可以主动进行肢体功能的锻炼，可以在他人协助下上下楼梯，走路，散步和四肢关节的伸展锻炼。还要进行语言方面的锻炼，平时多说话，一字一句的说，可以从学拼音开始。但在锻炼的同时，也要口服一些营养神经和活血降压的药物。
