肝内胆管结石和肝囊肿同时发生需要到正规医院接受治疗。如果肝内胆管结石呈淤泥状分布且直径相对较小，有时会随着胆汁代谢排出体外因此可以不用手术治疗。然而，如果结石的直径相对较大，并伴有明显的腹痛，需要手术治疗。因为直径较大时恶性转化的风险会相应增加。
通常情况下，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
胆管结石是临床胆石症的一种，临床上最常见的症状是上腹部疼痛，可呈胀痛或是绞痛，部分患者伴有发热。肝管梗阻时，可出的黄疸，通常来说，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
通常情况下，肝囊肿胆囊结石治疗方法是手术治疗。具体情况分析如下：
肝囊肿胆囊结石的囊肿直径超过8cm，病情出现压迫症状、继发出血、感染等情况时，患者必须进行及时到医院，通常囊肿开窗引流或囊肿切除手术进行治疗，如果存在多囊肝合并肝衰竭的情况，往往还需进行肝移植。如果是胆囊结石，建议到医院做腹腔镜下的胆囊切除手术治疗。
肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
可以通过药物刺激，分泌出的胆汁使胆囊口自动打开，胆管自动放大，胆囊收缩时，通过药物刺激变松弛的胆管排出，然后进入肠道，在肠道的蠕动下最终以排便的形式排出体外。
肝内胆管结石不及时治疗可能会导致肝叶萎缩、肝硬化等，具体如下：
肝内胆管结石主要与胆道感染、胆道寄生虫（蛔虫华支睾吸虫）、胆汁淤滞、胆管解剖变异、营养不良等有关。如果不及时治疗，结石可能会造成局部胆汁排泌不畅，导致肝叶萎缩、胆管炎、肝硬化等。建议患者及时治疗，以免造成严重影响。
在日常生活中，患者应注意休息，保证良好的睡眠，饮食以清淡、易消化为主，多吃新鲜蔬菜、水果，避免辛辣刺激、生冷的食物。
