肛瘘术后可以抽烟，但是尽量少抽。术后需要每天肛门中药坐浴，然后摸药膏，每天肛门消毒换药，大便后也需要清洗肛门。注意饮食，不能喝酒，不能吃辣椒，多吃水果和蔬菜，清淡饮食，保持大便通畅。便秘、腹泻会引起伤口水肿。一般术后一个月左右伤口可以完全愈合。
如果长期不治疗，危害很多，第容易引起一些分泌物；肛门周围会分泌一些东西，比如脓水，引起肛门周围的潮湿，引起污裤，就是内裤污染；另外可以引起皮炎湿疹。第肛瘘形成之后，可以在肛门周围形成一个肿块，肿块实际上就是肛瘘的瘘管，肿块时间长之后可以引起病人的疼痛。
肛瘘的鉴别诊断主要应当与肛门直肠周围常见疾病进行鉴别。比如肛周脓肿，也是一种感染性疾病，病情相对比较急骤，可伴有局部红肿，疼痛及波动感。其次，肛瘘也应当与肛裂进行鉴别，肛裂通常表现为便秘、便血和疼痛症状，肛门周围没瘘口存在。肛周皮脂腺瘤感染破溃之后与也不容易与肛瘘相鉴别，在详细检查之后，可以发现前者并没有与直肠腔内相通的内口。
做肛瘘手术需要住院的时间，因人而异，大部分情况下都是在一周左右，出院后还需要在家休养一两周才可以，自己注意饮食结构，需尽量保持营养丰富清淡的，预防便秘，大便之后还需要注意对伤口处进行清创消毒，避免大便刺激伤口。
肛周脓肿术后形成肛瘘常用症状有，切口久不愈合，肛门脓肿手术切口久不愈合，有脓牲分泌物从切口溢出，局部有压痛。切口愈合后不久局部又出现肿胀疼痛，一至二天左右自溃流黄水，且反复发作。
