平时能够积极的处理并发症，尿路感染，结石，高血压及肾衰竭等，则可明显延长寿命。也与个人体质有关，有些人在40岁之前就出现有肾功能减退，半数以上的在70岁时仍能保持肾功能，个别患者80岁也能保持肾脏功能。
多囊肾的情况一般是遗传的，而且随着年龄的增长会变大变多，还会出现腰部疼痛血压升高，肾脏B超结果异常等问题，多囊肾的遗传概率还是很高的，有多囊肾的女性为了孩子的健康，最好不要怀孕。如果非要孩子，建议多囊肾患者要偏食，饮食尽可能多样化，多吃高蛋白优质蛋白食物多吃蔬菜水果。
保守治疗，一般多囊肾处于早期，若出现相关临床症状，可做对症处理，如减少囊液分泌、降低血压或者采用一些结合的药物，来缓解患者的症状；手术治疗，多采用囊肿去顶减压术治疗，即把肾脏囊肿单独打开，降低对周围正常肾组织的压迫，保护正常肾组织的功能。
一般多考虑为先天性的这种多囊肾，如果有明显的增大或者是压迫症状是要进行手术治疗的。要到专业的儿童医院诊断明确以后，来选择经皮肾镜的微创手术，治疗的方式一般恢复周期在一个月的时间。
双肾囊肿不一定是多囊肾。多囊肾属于遗传性疾病，最常见的遗传方式是常染色体显性遗传，病人有双肾囊肿，两侧肾脏超过3个囊肿，同时有血缘关系的亲人中有类似的疾病病史，再合并多囊肝、多囊胰腺、肾衰、脑血管畸形等，基本可以诊断为多囊肾，否则囊肿数目再多也不能诊断多囊肾。
从出现肾功能下降至肾功能衰竭，一般为10年左右，患者肾功能衰竭后需要行肾脏替代治疗，且患者会出现多种并发症如贫血、继发性甲状旁腺功能亢进、肾性高血压等，肾衰竭后患者生存期限与其他靶器官的损害情况、并发症的控制情况均相关，生存期限从几年到二十年甚至三四十年均有可能。
