如果没有对肾实质造成压迫，不影响肾功能，通常不需要治疗。如果囊肿较大超过5厘米，压迫肾实质造成肾功能减退，需要尽早治疗，可以选择囊内注射硬化剂，或者是去顶减压术。平时应注意清淡饮食，避免喝浓茶咖啡等，有可能促进肾囊肿增长。
双肾囊肿不一定是多囊肾。多囊肾属于遗传性疾病，最常见的遗传方式是常染色体显性遗传，病人有双肾囊肿，两侧肾脏超过3个囊肿，同时有血缘关系的亲人中有类似的疾病病史，再合并多囊肝、多囊胰腺、肾衰、脑血管畸形等，基本可以诊断为多囊肾，否则囊肿数目再多也不能诊断多囊肾。
如果双肾囊肿体积比较小，个数比较少，大部分病人可能并不会出现明显的症状对肾功能影响也不很大，这时候往往不需要进行特殊的治疗，让病人进行定期的复查就可以，比如每半年到一年复查一次彩超。如果囊肿体积比较大，比如直径大约四厘米，病人有腰痛等一系列的症状，往往就需要通过积极的手术方式来治疗，才有可能会取得更好的效果。
肾囊肿是可以运动的，但是如果囊肿比较大，要避免剧烈运动。肾囊肿是肾脏的一种良性病变，好像皮肤上长了一个痣。在很小的时候，对于运动没有什么要求，不管是缓和的运动，还是剧烈的运动。如果囊肿比较大，这要选择那种比较缓和的运动，避免剧烈运动，尤其怕在剧烈运动过程中导致碰撞、挤压，有可能导致囊肿破裂而出血。
肾囊肿有分隔是正常情况，不会影响身体健康的，主要还是到医院进行定期的复查。如果囊肿慢慢增大，在必要的情况下建议进行做手术治疗。肾囊肿有分隔，是良性，应考虑多囊肾，是先天性肾发育不良引起的。
