氯氮平的相对严重的副作用是白细胞下降，属于较危险的副作用，需要定期检查血常规，观察白细胞是否有异常。若白细胞数量轻微下降，可服用增加白细胞类的药物，若白细胞下降较明显，需到血液科进行治愈。
氯氮平的副作用，有以下几种，镇静作用强和抗胆碱能力有不良反应的角度，常见的有头晕、无力、嗜睡、多汗、流口水、恶心、呕吐、口干、便秘，心动过速。常见食欲增加体重的增加。可引起心电图异常改变，可引起脑电图改变或癫痫病的发作。严重不良反应为粒细胞缺乏症以及继发性感染。可引起尿失禁和中枢系统紊乱。
氯氮平的维持量，基本为100毫克到200毫克，病情稍微严重，每日量为200-400毫克，最大剂量不得超过600毫克，氯氮平药的维持量最低可到0.5毫克，但有个体差异，不是每个人都一样的，需郑重其事，为了摆脱其西药，寻求治好。
氨能够干扰脑细胞能量代谢，氨可以抑制丙酮酸脱羧酶的活性，可以使乙酰辅酶a生成减少，影响三羧酸循环的进行。氨会消耗大量的ATP，还会使脑细胞ATP产生减少，所以会抑制脑细胞，从而产生中毒。
糖尿病酮症酸中毒是糖尿病的一种急性并发症，可发生在1型糖尿病或二型糖尿病中。
1型糖尿病患者由于胰岛素的绝对缺乏，容易出现血糖代谢异常，血糖明显升高导致代谢紊乱，酸性物质积聚导致酮体产生，出现酸中毒。二型糖尿病患者在应激状态下往往升糖激素升高，胰岛素相对不足，导致血糖显著升高，并伴有脂肪消耗和酮体生成增加。酸性物质的积累导致糖尿病酮症酸中毒。一旦出现糖尿病酸中毒，说明胰岛素绝对缺乏或相对缺乏，需要给予胰岛素降糖、生酮、补液治疗。注意积极消除原因。二型糖尿病患者的常见诱因是感染，应积极控制感染，以便更好地纠正糖尿病酮症酸中毒。
长期服用的后果会直接影响肝、肾、脑等功能。而且氯氮平片的副作用是，镇静作用强和抗胆碱能不良反应较多，常见有头晕、无力、嗜睡、多汗、流涎、恶心、呕吐、口干、便秘、体位性低血压、心动过速。
