气管肿瘤可以切除肿瘤，体积小的气管良性肿瘤可在内窥镜下作电灼切除，或施行切开气管切除肿瘤，或切除肿瘤时连同切除一部分气管壁，再缝合气管缺损。气管恶性肿瘤或较大的良性肿瘤，则需切除病变段气管和作气管重建术。
气管肿瘤不管是良性肿瘤还是恶性肿瘤，都以手术切除为主，对于放疗有一定敏感度的气管恶性肿瘤和鳞癌，腺癌样囊性肿瘤，恶性淋巴瘤，类癌，小细胞癌等都可以补加放疗，有时候因为肿瘤太长又有明显外侵不宜进行手术切除可以采用单纯的放疗。一般化疗对气管肿瘤来讲效果不明显。
手术切口两三个周一般就愈合了。干重活的话得半年到一年。很多病人术后可能2—3天就可以出院。术后，病人恢复到术前水平的时间不等。术后早期可能症状恢复得很好。对于此类病人，术后休息2周左右，手术造成的影响基本可以消失。
如果气管是恶性的，这种是非常罕见的。气管癌的主要症状是吸入性呼吸困难，或吸入时出现喘息，随着体位的改变，症状可能加重或减轻。在早期，可能会出现声音嘶哑和呼吸困难。困难，逐渐加重，以及刺激性咳嗽，这种需要注意。
气管肿瘤不一定就是肺癌，但是如果肿瘤出现癌变，就会变成肺癌，此时治疗是比较麻烦的。气管肿瘤发生癌变就是支气管癌，是肺癌的一个特殊类型，肿瘤长在支气管黏膜上。考虑做手术治疗。病理类型和普通肺癌基本一样。有气管肿瘤的建议戒除烟酒，因为吸烟多和小细胞肺癌和鳞癌相关。积极配合治疗，注意休息，饮食以清淡为主。
支气管肿瘤化疗需要注意定期查血常规、生化，白细胞、血色素、血小板维持正常，如发现白细胞降低，则需注射粒细胞集落刺激因子等，饮食丰富、合理、平衡，减少进食刺激性的食物。