治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
改善灰指甲，可以适当补充维生素C、维生素B以及维生素A来提高人体抵抗力。如果人体缺乏维生素A、维生素B以及维生素C这些营养元素，可能会导致人体的抵抗力下降，进而容易遭到外界真菌感染，进而引起灰指甲的问题。而想要改善灰指甲，除了补充这些维生素之外，还需要针对真菌感染进行治疗，患者可以使用能够杀菌的外用药物，例如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，该药是治疗灰指甲的专用药，含有聚维酮碘、阿司匹林等杀菌成分，能够帮助杀灭深层真菌，改善灰指甲的问题。症状严重时，可遵医嘱将亮甲联合斯皮仁诺特比萘芬胶囊、丁克盐酸特比萘芬片等抗真菌口服药物治疗。
灰指甲一般可以到公立医院皮肤科进行系统的治疗，治疗的费用跟使用的药物以及检查有关。一般可以使用抗生素药物治疗，具体用药谨遵医嘱。有可能是小朋友不注意卫生导致的真菌感染，引起指甲出现碎屑堆积，变小，无光泽，指甲变厚等灰指甲的症状。
一旦确诊需要注意卫生，切断传染源，用过的物品必须严厉消毒，因为病原体是真菌，需要通过抗真菌的药物才能更好的改善。需要中西药结合治疗，可以使用中药缓解。可以适当做一些轻微的运动，吃一些有营养的水果和蔬菜。
甲癣是指甲的真菌感染，查明甲癣是否真的存在，一种是进行真菌培养或相关检查，以确认是否是，然后需要到当地医院的皮肤科去看医生，然后给抗真菌药物，目前有外用和口服药物，如有必要，拔出指甲进行治疗是可行的。
