脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
一般来说，脑炎的后遗症症状主要有：发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，甚至还会影响到大脑、丘脑下部等。
有些患者会出现兴奋多语、烦躁、哭笑无常、行为异常、失眠、记忆力减退、大小便失禁等症状。除此之外，智力下降，大脑迟钝，眼睛发麻，吞咽困难也会偶热如出现。严重的患者会出现癫痫性头痛、抽风、四肢抽搐等症状。
脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为神经精神方面的异常，神经异常的表现多有，发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥。重者则大脑丘脑下部底节脑干小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
脑炎是有可能在治疗之后留下后遗症，有一些人会表现为耳鸣。脑炎是一种危害性比较大的疾病，如果患者的病毒损害部位位于额叶或颞叶，相对来说影响较小。但是如果患者的病毒损害位于间脑部位，甚至还有可能会危及生命，需要尽早地到医院去进行治疗。
在急性期通过正规治疗，较少出现脑炎后遗症，多数患者预后较好。病情严重者可出现后遗症。根据脑组织损伤部位不同，临床表现多种多样，如痴呆、言语障碍、哭笑无常、多汗，以及癫痫发作，即反复抽搐。
