肾囊肿的治疗需因人因病情而异，不可一概而论，因为肾囊肿发展慢，在无症状时不损害肾脏，对健康无危害，且患者发现时一般年龄较大，因此对于无症状的患者，即使囊肿较大也可不行治疗，如患者腰部疼痛、排尿异常系由于肾囊肿引起，且肾囊肿直径在5cm以上，可采取手术治疗，但容易复发。
孕妇出现肾囊肿是不太严重的一种病症。但是建议密切观察。
肾囊肿，顾名思义，就是肾实质的一种囊性病变，通常为良性病变，若肾囊肿的体积很小，只要经常复查。若患者出现血尿、蛋白尿等肾功能损害时，就应该到医院就诊。孕妇若出现肾囊肿，无明显症状，可暂时不需要办理，甚至更大，亦可于投产后处理。建议定期进行产前检查，明确胎儿和孕妇的身体状态。
肾囊肿是可以运动的，但是如果囊肿比较大，要避免剧烈运动。肾囊肿是肾脏的一种良性病变，好像皮肤上长了一个痣。在很小的时候，对于运动没有什么要求，不管是缓和的运动，还是剧烈的运动。如果囊肿比较大，这要选择那种比较缓和的运动，避免剧烈运动，尤其怕在剧烈运动过程中导致碰撞、挤压，有可能导致囊肿破裂而出血。
肾囊肿有分隔是正常情况，不会影响身体健康的，主要还是到医院进行定期的复查。如果囊肿慢慢增大，在必要的情况下建议进行做手术治疗。肾囊肿有分隔，是良性，应考虑多囊肾，是先天性肾发育不良引起的。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
