肾及输尿管结石的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧，有无尿流梗阻、伴发感染、肾功能受损程度、全身情况以及治疗条件等进行具体分析，全面考虑。但当绞痛发作时，首先应该使症状缓解，而后再选择治疗方案。非手术治疗方法有大量饮水，中草药治疗，针刺，经常作跳跃活动。或者体外冲击波碎石。结石引起尿流梗阻已影响肾功能、或经非手术疗法无效，无体外冲击波碎石条件者，应考虑手术治疗。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。
尿结石本身并不严重，但是由于尿结石的存在，容易引起一些其他的疾病，对于健康造成严重的影响。输尿管结石容易造成泌尿系统梗阻，造成梗阻以后肾脏分泌的尿液不能及时的排出体外，容易引起肾脏积水。肾脏积水等于肾实质有压迫的症状，容易引起肾实质变薄、肾功能减退或丧失。
如果疼痛比较剧烈，可以遵医嘱肌肉注射止痛药物。同时到正规三甲以上医院泌尿外科检查。可以做尿常规检查，泌尿系彩超检查，肾脏CT检查等，看一下结石的位置和大小。明确诊断，对症治疗，可以口服药物暂时保守治疗，也可以微创取石治疗，生活中注意调养，多喝水，多做跳跃运动。少吃绿叶蔬菜和动物内脏等。
首先是肾盂结石，治疗方法包括体外冲击波碎石、经皮肾镜超声碎石取石术等。其次是输尿管结石，治疗方法有体外冲击波碎石等。最后是膀胱结石，可以行经尿道膀胱结石激光或气压弹道碎石取石手术。
尿路结石大于6毫米就需要手术治疗，看位置要看体外碎石还是经尿道排出的，可以出现腰腹部隐痛，可以先采取碎石治疗的，其次碎石后需要采取排石的药物治疗，如果治疗效果不好则是可以采取经尿道激光碎石治疗。
