根据病情选择支气管镜下取石，或者是手术切除的方法。对于不伴有肺实质损伤的，可以首选支气管镜下取石，微创的并发症较小。对于反复出现肺部感染，以及反复大量咯血以及肺脓肿的，可以选择手术切除的方法。
牙结石可以用电动牙刷，洗牙，龈下刮治的方式去除。牙结石是由于牙齿表面出现黄色的钙盐堆积物黏附后形成，从而产生牙齿发黄、牙龈感染，产生口臭等症状。平时饮食尽量多吃粗纤维食物，粗纤维的食物能对牙齿表面起到摩擦的作用。
结石疼的时候可以肛门内给药，最常见的就是双氯灭痛栓50mg纳肛，一般3-5分钟就可以缓解疼痛。也可以肌肉注射止疼药物，比如强痛定、杜冷丁、654-2、黄体酮等，也可以静脉滴注间苯三酚、654-2。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
孕妇出现肾结石的治疗需要根据症状来选择。
如果孕妇没有临床表现，只是通过身体检查发现存在肾结石，一般不需进行特殊治疗。如果孕妇出现了腰腹部疼痛等临床表现，可以采用解痉止痛的药物，如果无效，可以在输尿管中留置双J管，等到宝宝降生后再进行治疗。
建议孕妇定期进行产检，了解身体情况和胎儿情况，发现问题后早治疗。
