CINI的处理原则上不需要治疗，但一定要进行随访，定期复查宫颈液基薄层细胞（TCT）和人乳头瘤病毒（HPV），有症状的CIN1则要治疗。医院可根据TCT、HPV及阴道镜检查结果，综合考虑，采用个体化、规范化、人性化和微创化的方案。
CIN3一般指宫颈上皮内瘤变CIN三级。通常情况下，宫颈上皮内瘤变CIN三级是一定要做宫颈锥切术的，因为宫颈CIN三级属于宫颈上皮高度病变，异形细胞已经扩展到上皮的下2/3层甚至全层，如果不及时进行治疗，可能会导致癌变。其治疗方法可以采用宫颈椎切术、宫颈环形电切术、冷刀锥切术等。如果患者年龄较大、无生育要求者，也可以选择全子宫切除术。
宫颈上皮内瘤变2级锥切后可以用上消炎药物来预防感染就好，而且术后消炎治疗五天左右的时间就可以，然后还需要多注意休息，有一个合理的生活和饮食习惯，会逐渐好转或痊愈的。
子宫颈上皮内瘤变2级不是癌症，但是是癌前病变。子宫颈上皮内瘤变是介于子宫颈炎症与子宫颈癌之间的一类病变，与HPV的感染密切相关，治疗包括子宫颈环形电切除术和冷刀锥切术。
可以采取锥切或者LEEP刀治疗，冷刀切出血风险相对高一些，术后都要注意是否有出血倾向，少量流血不要紧，但是出血较多应该立即就诊。所以结合是否有生育要求，可以积极手术治疗。
宫颈上皮内瘤变2级要紧，宫颈上皮内瘤变2级系宫颈高级别上皮内瘤变，有发展为宫颈浸润癌的可能，需要治疗。治疗的方式主要以手术治疗为主，对于阴道镜检查充分可行宫颈锥切术或消融治疗，阴道镜检查不理想亦采用宫颈锥切术，包括宫颈环形电切术和冷刀锥切术。
