亚临床甲状腺功能减退，原因大致可分为以下4类：
1、原发性甲状腺功能减退。它约占亚临床甲减的96%。
2、继发性甲状腺功能减退。这种情况很少见，主要是由于垂体性疾病导致促甲状腺激素分泌减少。
3、下丘脑性甲状腺功能减退。它主要由下丘脑产生的促甲状腺激素释放激素减少，垂体促甲状腺激素分泌减少引起。
4、外周对甲状腺激素作用的抵抗。甲状腺激素通过核受体发挥生物学效应，与受体的缺乏、t3、t4与受体的结合障碍，以及受体后缺陷，都可能引起外周抵抗甲状腺激素作用，引起甲状腺功能减退。
妊娠期伴有亚临床甲状腺功能减退，必须行甲状腺激素替代治疗。
由于研究发现，妊娠期甲状腺功能甚至正常TSH要求也不符合标准，即不少于2.5，对胎儿后期发育，特别是脑与神经、运动神经可产生不同程度的效应，因此又为优生优育服务，甚至无亚临床甲减，若TSH超过2.5，则需甲状腺激素替代治疗。并对整个怀孕期间进行及时监控，甲状腺功能改变，可每隔2~4周做一次甲状腺功能检测，医生与病人甲状腺功能相结合，将开发出合适的甲状腺激素替代治疗方案。
一般来说，亚临床甲状腺功能减退症主要看甲状腺功能的指标。
促甲状腺激素升高，游离T4的指标正常；促甲状腺激素升高，游离T4的指标下降，都表示亚临床甲状腺功能减退。除此之外，甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体升高，表示可能出现甲状腺炎，而甲状腺有弥漫性肿大的话，就提示桥本甲状腺炎，此种情况下，就可能发展成为亚临床甲状腺功能减退症。
可通过药物治疗，将血清甲状腺素正常而促甲状腺素值升高的情况称为亚甲减，亚甲减症状并不特异，多表现为甲状腺肿大，目前人认为，仅TSH值升高，即使无临床症状通常也可诊断为亚甲减。
亚临床甲状腺功能减退症或亚甲减是一组在临床上很常见的内分泌疾病，其特征是甲状腺水平在正常范围内，然而垂体促甲状腺激素TSH的水平较高，因为TSH能比甲状腺激素更加灵敏地反映出来。
有些患者，TSH在正常稍高范围没有超过10的时候，可能没有任何的临床表现，也不会影响工作和学习，只是在偶尔体检中发现的，那么这种情况称为轻度的亚甲减。
有些病人TSH含量在10以上，但T3T4含量仍在正常值内，这就是严重亚甲减。重度亚甲减患者，可出现甲减表现，比如乏力、精神萎靡、便秘、体重增长、困倦等症状。因此若为重度亚甲减影响学习、生活，可采用药物治疗。
亚临床甲状腺功能减退症要做以下几个检查：
1、化验甲状腺的功能，通过游离甲状腺素和促甲状腺素的数值。可以做出判断。
2、甲状腺的彩超检查。通过彩超检查，可以发现甲状腺有无肿大，有无钙化、血流是否丰富等。
3、如果患者有甲状腺结节等方面的问题，还可以做甲状腺的穿刺，通过病理结果来明确诊断。
4、颅脑MRI检查：可以排除下丘脑、垂体疾病。