一般情况下，突眼性甲亢可通过使用药物或进行手术治疗，具体内容如下：
突眼性甲亢的治疗主要是要进行甲亢的控制，突眼的病情比较轻微的病人可以通过药物进行局部的药物治疗，避免出现眼睛怕光和流泪的现象，也可以选择使用人造泪液或者是晚上覆盖的方法。如果出现突眼的情况，可以通过口服或静脉注射泼尼松片等药物来控制甲状腺功能亢进，也可以进行眶内放疗或者眼窝减压的方法进行手术治疗。
可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
患有甲减的人还可以吃一些药物引起的突眼。
目前关于甲状腺有关的疾病的病因和发病机理还没有彻底弄明白，但在临床上可以发现，抽烟和心理方面的原因可以促进该病的发展，加快疾病的加重，从而影响到治疗的疗效。另外，甲亢是导致甲状腺有关的眼病最主要的原因，除了甲亢之外，还有一部分桥本氏甲炎，还有一部分甲状腺机能低下的病人。此外，也没有任何遗传学检测可以证实，这是一种遗传疾病。
如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
一般情况下，轻微甲减可通过日常护理、使用药物等措施进行治疗，具体内容如下：
甲减的治疗方法是以甲状腺激素代替疗法为主，优甲乐和甲状腺激素篇是比较常见的药物。首先是低剂量，然后是通过全身的表现和化验的结果，逐步增加，直至所有的病症都没有了，t3、t4、ft3、tsh都会回复到原来的水平。从那以后可能也需继续服用，避免随意中断，不然1-3个可能就会有复发的情况。日常生活中要多吃些低脂肪食物，多补充碘。
