如果肺囊肿不大，如在两厘米之内，可以对症治疗，比如消炎，止咳化痰，退热等方法。如果囊肿相对大，即大于两厘米以上，这种是需要手术治疗的，手术治疗效果还是比较明显。
手中指关节处长得囊肿可以通过挤压或捶击，使其破裂逐渐自行吸收，也可以手术切除。术后应避免患病的关节剧烈活动1个月，注意休息，同时不能够沾水，痊愈后手指也不能过度的疲劳活动和工作，否则会容易反复复发。
肺囊肿属于良性的病变，该病一般是先天的发育异常所引起的症状表现也会有较大的差异，比较小的囊肿，一般是没有任何症状的，也有可能合并有反复的感染等表现，如果确诊之后症状表现比较明显的，还应该考虑进行手术治疗的。
少数肛周囊肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，注意忌酒和辛辣刺激食物，多吃蔬菜水果、多饮水，保持大便通畅，保持肛周清洁干燥，适当运动。
巧克力囊肿的治疗方法一般会根据年龄，生育要求和包块的大小及性质来决定的，尽快去医院根据病情进行手术治疗，如果囊肿的尺寸比较小，可以药物活血化瘀治疗，如果囊肿的尺寸比较大，可以通过腹腔镜下进行手术处理。
很可能是腱鞘囊肿，是关节部位外伤和慢性劳损造成的，服用药物治疗没有效果。可以采取关节部位热敷，按摩等方法进行处理，如果囊肿较大，可以采取穿刺的方法抽出囊液进行治疗，也可以采取手术的方法切除治疗。外科就诊，必要时手术治疗。
