通常情况下，在停经35-49天时适合做药物流产。
药物流产是指用米非司酮片加米索前列醇药物口服终止早期妊娠。目前常用的药物是米非司酮片和米索前列醇联合应用，前者使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化，后者使子宫兴奋、子宫收缩，促使胚胎排出，而为了避免难以排干净胚胎组织或者引起身体不适，建议在停经35-49天时适合做药物流产。
子宫腺肌症一般不太好怀孕。
患有子宫腺肌症的人并不是很好妊娠，可能和卵巢功能异常有一定关系。由于雌激素水平下降，使卵巢内环境紊乱，引起内膜细胞增殖分化失调，造成子宫平滑肌肥大及腺体增生等变化。子宫腺肌病病灶会合成或者分泌多种细胞因子，病人卵泡及黄体细胞表面黄体生成素受体量下降，造成黄体分泌缺乏，黄体形成差，因而影响受孕，能干扰胚胎正常宫腔植入着床过程。此外，还可能引起不孕不育等并发症。
子宫腺肌症能怀孕，不过受孕的几率很小。
子宫腺肌症能否怀孕取决于病变的部位、大小、症状等因素，受孕率也不同。通常情况下，只要是轻微的病变，都有可能自行受孕，若子宫的腺肌症病变范围很广，甚至很难受孕，需要通过外科手术，或是通过聚焦超声将病变切除，然后通过药物和注射来阻止经期，可以提高怀孕几率。患者应该注意休息，积极接受正规治疗，有利于身体恢复。
孕囊在0.5-2.5cm间适合做药物流产，这时大约在怀孕35-49天之间，如果孕囊太小这时激素水平比较低，对药物敏感性也比较差，容易造成不全流产。如果是孕囊太大，超过2.5cm说明怀孕时间比较长，如果用药物流产有时可能会出现大出血，有时可能会出现不全流产。所以选择在孕囊0.5-2.5cm间，这段时间做药物流产，则完全流产率是比较高且出血比较少，安全性比较大。
通常情况下，怀孕是不能治子宫腺肌症的。
孕妇可以继续怀孕，也可以通过怀孕来进行治疗，比如子宫腺肌症，可以使用一些药物来进行科学的假孕，从而消除体内的周期荷尔蒙水平的改变，这样就可以保住孩子，不过要定期进行孕期检查，看看有无明显的子宫腺肌症。必要时孕妇可能需要去医院终止妊娠。另外，在患病期间孕妇应注意日常护理，从而促进胎儿的伸展与发育。
