慢性骨髓炎的手术禁忌症有以下几方面：
1、慢性骨髓炎急性发作期间不宜进行病灶清除手术，待进行抗菌治疗，全身症状以及病情稳定后在进行手术。
2、大块死骨形成且周围骨质增生形成的包壳不完整，大多数慢性骨髓炎是因急性化脓性骨髓炎治疗不当或不及时，病情发展的结果。
3、全身状态不好，比如营养不良、心肺功能衰竭、肝肾功能不良。
针对各类型慢性骨髓炎来讲，单纯采用疗法，很难获得永久性治愈。服用中药丸剂或汤剂是从整体上将体内毒素―外邪排除。伤口不能过快愈合。否则，毒素在未排净的情况下滞留体内，短期内势必使皮肤再次溃破。而且细菌对中药几乎没有耐药性。总之治疗是让伤口由内向外愈合。这种愈合才是一种彻底的治愈。
慢性骨髓炎可以采用抗菌药物治疗，可以联合手术引流，或者病灶清除进行治疗，同时饮食上要注意多吃一些，蛋白质含量高的食物，纤维素含量，维生素含量高的食物。慢性骨髓炎是急性化脓性骨髓炎的延续，一般症状局限在局部，往往顽固难治。
慢性骨髓炎经常是由于急性期未能及时治疗，或有异物存在，或由感染引起。需要在骨科就诊。给予足量的抗生素进行抗菌治疗手术清除病灶，摘除死骨，清除增生的瘢痕和肉芽组织，消灭死腔，改善局部血液循环，为愈合创造条件。
慢性骨髓炎的手术指征是由蚀骨形成、有室腔以及窦道流脓者。
1、病变周围的软组织纤维瘢痕化、骨质坏死、骨质反复炎性增生、骨质硬化、髓腔封闭、脓液积聚、死腔形成等。
2、慢性窦道的形成和长期存在，并且窦道长期存在，反复的炎症刺激会使窦道附近的皮肤发生癌变。
3、产生耐药菌株、混合感染等，很难找到合适的抗菌药物。
因此，在慢性骨髓炎的治疗中，必须采用外科和药物的结合。
慢性骨髓炎能可以治好。根据细菌培养和药物敏感实验结果选用合适的抗生素。门诊患者，抗生素多用口服或肌注。住院手术患者，抗生素以静滴、肌注为主。术前、术中均需要使用抗生素直至术后2周。手术彻底清除病灶。急性发作期患者须大剂量抗生素静滴或早期切开引流手术。恶变、或晚期多次手术、功能已丧失者，可行截肢手术。
