采取非手术措施控制急性炎症期。症状缓解后，可选择手术。内窥镜手术创伤小，疼痛小，适用于下胆总管结石数量少，直径小。如果持续半小时，腹部用胀痛感，可以考虑为胆囊结石引起的，可以进行彩超检查，有疼痛感，可以口服利胆消炎的药物调理的，也可以采取中药调理。在治疗期间，不可以吃刺激性、油腻的食物的慑入。
胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
胆囊结石做胆囊切除手术是有一些指征的，当没有症状而且结石较小的时候可以完全不手术，临床随访观察就行了，比如每年一次进行健康体检。当结石＞3㎝的时候，由于结石对胆囊壁的持续刺激会导致胆囊癌的发病率大大的增加，因此不管有没有症状，对于胆囊巨大结石行胆囊切除手术。
对于育龄期妇女来说，如备孕，则并发胆囊结石，根据胆囊结石特定结石大小和多少确定治疗方案。
若符合相应手术指征，仍推荐早期手术。怀孕初期是一个特殊阶段，因为胎儿刚刚进入子宫，所以要特别注意保暖。则术后、康复后，一次或几次月经期后，通常的意见是最少见3个月，再次妊娠可降低妊娠时合并胆囊炎症的发生率，并造成部分全身反应不适，以及降低该炎症对于胎儿所产生的对应作用。另外，对于妊娠期来说，也要注意适当控制体重，以免出现妊娠高血压综合征等症状，从而造成严重的后果。
因此，如在孕前已证实胆囊结石，或提示病人孕前服用，胆囊作相应切除，以解决胆囊结石的问题。
在临床上胆囊结石的手术治疗是一个大手术的。期间病人可以在做详细的胆囊部位B超和CT检查后选择传统的胆囊切除手术来进行治疗。另外病情严重时也可以通过腹腔镜下胆囊切除手术来进行根治的。
