月经干净第二天同房是不会怀孕的。
这段时间即使没有进行任何的保护，怀孕的也可能性非常小。怀孕是指在子宫内膜发育到一定的程度后，受精卵就会着床妊娠。女性在经期后的第一日，由于体内的子宫内膜比较稀疏，所以不能达到受精卵着床的要求。在排卵期同房时，有比较高的受孕概率，一般是在下一次来潮的十四日左右。在两个周期之间，女性的排卵期通常会维持2-3天。如果没有怀孕需求，可以采取节育的方法。
由于每个女性的月经周期不同，而且月经期也有长短差异，所以在来完月经第二天同房，仍然可能会引起怀孕。因为安全期通常是指月经第一天的前七天和后八天，如果女性月经不规律，月经周期提前，而月经经期又延长，那月经干净后第二天可能是在排卵期，此时会有卵子排出，同房时又未采取避孕措施，就可能会导致怀孕。同时女性在同房时受到性兴奋刺激，可能会引起异常排卵，这种情况也可能会导致怀孕。
月经没走干净同房可能会导致经期延长、炎症感染。
由于还没有到经期结束，由于子宫内膜尚未完全剥落，子宫内膜较稀疏，处于比较虚弱的状态，性生活会使子宫收缩，出现小腹部的痉挛和痛苦，同时也会使子宫内膜的剥落加快，从而使经期延长。此外，女性性生活时，细菌很容易通过阴道进入子宫，导致阴道炎、盆腔炎等疾病，甚至还会导致炎症扩散到输卵管，从而影响女性的怀孕。
正常的情况下在月经期是不会发生憋气症状的，如果发生了呼吸困难憋气的症状需要及时检查是不是有心肺疾病引起的，月经期由于阴道出血如果出血量过大可以引起贫血，有贫血的情况下可以出现胸闷呼吸困难的症状，但是并不会发生明显的憋气症状。如果有气管炎，肺炎的时候，也会出现憋气的现象，如果有神经功能紊乱，也会导致憋气的现象。只需要对症治疗。
例假结束后的第二天是在安全期内，同房如果没有采取避孕措施，仍然有可能会怀孕。在同房后十天可以去做抽血检查hcg来判断是否怀孕。如果频繁人流的话，有可能会对以后生育造成影响。
通常情况下，月经第十二天内膜厚度9mm左右为正常。具体情况分析如下：
女性在雌激素的影响下，子宫内膜会逐渐变厚，在月经的22天，就会达到排卵期的子宫内膜厚度，通常9mm左右为正常。如果厚度在9mm以下，受精卵无法着床，随着月经周期的延长，子宫内膜会越来越厚。在月经之前，子宫内膜会在12-13毫米之间。
